بعد حصوله على شهادة في الهندسة المدنية من الجامعة الأميركية في بيروت وماجستير في إدارة الأعمال من جامعة إنسياد في فرنسا، أمضى الوزير عيسى الخوري عدة سنوات في مصارف استثمارية بين باريس وبيروت حيث شغل مناصب عدة.
سمحت له خبرته بالمشاركة في مجالس إدارة العديد من المؤسسات في بلدان مختلفة كما غطت مهام الوزير عيسى الخوري مجالات متنوعة كإدارة المحافظ المالية والثروات، تمويل المشاريع، اعادة هيكلة الشركات، عمليات الدمج، أسواق رأس المال، فضلاً عن الاستثمار العقاري.
على الصعيد الشخصي، شغل الوزير عيسى الخوري لسنوات عديدة منصب رئيس جمعية خريجي إنسياد في لبنان والأمين العام لتجمع رجال الأعمال اللبنانيين ونائب رئيس الرابطة المارونية.
الوزير عيسى الخوري متزوج وله ولدان ويجيد الفرنسية والإنجليزية والعربية ويتّقن الإسبانية.
